16S rRNA 序列具有高度保留及變異序列的區域,利用此特性可做為微生物物種的分類代表(Tag) 。而經由次世代定序(NGS)快速獲得高通量16S rRNA序列。進一步生物資訊分析(bioinformatics) 將序列資訊與包含上千種微生物16S rRNA序列資料庫比對、分群,可準確推斷其菌相組成及菌種之親源性。目前微生物菌相分析已知可用於解決在醫學,工程,農業和生態上的問題與挑戰,協助探討這些菌種對於環境及生物體等表現或狀態之影響。本中心開放的服務如下:
DNA服務項目 | 樣品需求 | 建議定序方式* | 服務時程(月) | 價格(每一樣本) |
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Amplicon-seq 16S metagenomics |
>100 ng DNA 260/280>1.8 260/230>1.8 |
1~10 samples (detail classification) 11~20 samples 21~30 samples 31~40(Max) samples (screening) Pair-end sequencing |
2
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Barcode: 14,000 Barcode:9,000 Barcode:6,500 Barcode:5,500 ※需另加生物資訊分析費用30,000元/每批 |
* DNA quality will need be tested in the QC qPCR assay.