透過技術的改良及進步,新一代的定序技術(Next Generation Sequencing; NGS)的解讀能力可完整的檢測及量化整個基因組包括生殖和體細胞的遺傳變異。隨著NGS成本不斷的下降,次世代定序已經廣泛地應用在學術研究、臨床檢測和伴隨式診斷。成大基因體醫學中心擁有兩大次世代高通量定序平台,包括了Illumina NextseqSeq 及MiSeq。在提供的服務上,Illumina Nextseq定序產生的序列讀長約75-150鹼基,Illumina MiSeq定序產生的序列讀長約50-600鹼基,可依需求來選擇適合的系統進行定序。本服務由受過專業操作訓練的技術人員執行,檢驗室有標準的操作動線流程,使定序工作做到品質恆定、迅速確實、及價格合理之目標。此外,本中心亦有提供代上機服務,由送檢單位提供製備完成之文庫,完成定序後提供原始數據。本中心開放的服務如下:
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服務項目 | 樣品需求 | 建議定序方式* | 服務時程與價格 |
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Whole genome sequencing |
>1 μg DNA >50 ng/ μl OD260/280>1.8 |
>20M reads single-end sequencing (1X) >300M reads paired-end sequencing (30X) | 專案分析請洽詢
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Whole exome sequencing |
>1 μg DNA >50 μg/ μl OD260/280>1.8 |
>20M reads paired-end sequencing (100X) | 專案分析請洽詢
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Nextseq550 上機服務 |
4nM library pool | Mid Output Kit v2.5(150 cycles) | 8,000元/Run |
Mid Output Kit v2.5(300 cycles) | 13,000元/Run |
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High Output Kit v2.5(75 cycles) | 11,000元/Run |
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High Output Kit v2.5(150 cycles) | 21,000元/Run |
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High Output Kit v2.5(300cycles) | 34,000元/Run |
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Miseq 上機服務 |
4nM library pool | MiSeq Reagent Kit, v2 (50 cycles) | 8,700元/Run |
MiSeq Reagent Kit, v2 (300 cycles) | 11,100元/Run |
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MiSeq Reagent Kit, v2 (500 cycles) | 12,500元/Run |
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MiSeq Reagent Kit, v3 (150 cycles) | 9,600元/Run |
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MiSeq Reagent Kit, v3 (600 cycles) | 16,000元/Run |